Бакуганы живут в галактике под названием Вестроя. Когда под воздействием неизвестного катаклизма Вестроя разделилась на 6 миров: мир Воды (Аквоса), мир Ветра (Вентуса), мир Земли (Сабтерры), мир Света (Хаоса), мир Тьмы (Даркуса) и мир Огня (Пайруса) — все бакуганы, ранее бывшие едиными, соответственно разделились на 6 стихий. В результате разделения Вестроя и её Центр также разделился на две части: Зону Бесконечности, заключающую в себе положительную энергию, и Зону Безмолвия, заключающую в себе отрицательную энергию. Также в момент разделения Вестрои родились два новых бакугана, не имеющие своей стихии, а соответственно силы, белые или забытые бакуганы — Нага и Вэйф. Нага, лелеющий мысли о могуществе, решил захватить Зоны Бесконечности и Безмолвия. Но Зона Безмолвия втянула его в себя, а Зона Бесконечности вошла в его сестру Вэйф. Все это вызвало новый катаклизм в Вестрое, благодаря которому бакуганы попали на Землю. Там все они были свернуты в небольшие шары, которые умещались в руке. Люди подобрали «упавших с неба» бакуганов и придумали с ними игру. То же самое в свое время произошло и на Вестрое. После того, как Драго совершил Волшебный Переворот и восстановил целостность Вестрои, соединив все шесть миров в один, разделение бакуганов на стихии тем не менее осталось. В 3 сезоне бакуганов стали создавать при помощи виртуальности («Бакуган Интерспейс»). В Нифии и Гандэлии бакуганы появились по другому. Создатель бакуганов — Код Ив, который на самом деле является Кристалл Нифии. Забавно, но все бакуганы с одной планеты. И когда мир бакуганов разделился на стихии, половина бакуганов отправилась в другую точку Вселенной (в Гандэлию и Нифию). В Гандэлии осталась большая часть бакуганов 5 стихий, а у Нифии остались бакуганы Хаоса.